1月9日，在人民大会堂召开的国家科学技术奖励大会上，北斗二号卫星工程荣获国家科技进步奖特等奖，这是国家对北斗系统建设阶段成果的高度认可和重大褒奖，是对北斗系统建设全线人员的极大激励和有力鞭策。大会上，工程高级顾问李祖洪、谢军总师代表研制队伍上台领奖。北斗二号卫星工程是国家科技重大专项，是我国北斗卫星导航系统建设"三步走"发展战略承前启后的关键一步，建成我国自主创新、独立运行的北斗卫星导航定位系统，对国家安全和经济社会稳定发展具有重要的意义。
北斗导航卫星研制团队始终遵循科学发展规律，以北斗导航卫星系统研发为中心，突破了一批关键核心技术，建立了国内一流的研究与试验条件，培养了一支自强不息、持续创新的人才队伍，取得了一批在国际国内具有重大影响力的科技成果，实现了中国导航卫星系统从无到有，为中国航天事业及导航卫星系统的技术进步和整体发展做出了开创性的突出贡献。
此外，在此次2016年度国家科学技术奖励中还有嫦娥三号工程荣获国家科技进步奖一等奖、海洋二号卫星荣获国家科技进步奖二等奖。
